Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2Z4

NKX2-4, Homeobox protein Nkx-2.4, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-4Q9H2Z4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NKX2-4Q9H2Z4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX2-4Q9H2Z4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms