Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
INO80BQ9C086 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
INO80BQ9C086 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms