Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM7Q9C029 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM7Q9C029 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms