Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM9Q9C026 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms