Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC13A1Q9BZW2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A1Q9BZW2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms