Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms