Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY50

SEC11C, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC11CQ9BY50 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEC11CQ9BY50 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC11CQ9BY50 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC11CQ9BY50 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC11CQ9BY50 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC11CQ9BY50 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC11CQ9BY50 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC11CQ9BY50 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC11CQ9BY50 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC11CQ9BY50 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC11CQ9BY50 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC11CQ9BY50 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC11CQ9BY50 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC11CQ9BY50 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC11CQ9BY50 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC11CQ9BY50 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC11CQ9BY50 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC11CQ9BY50 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC11CQ9BY50 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC11CQ9BY50 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC11CQ9BY50 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC11CQ9BY50 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC11CQ9BY50 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC11CQ9BY50 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC11CQ9BY50 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC11CQ9BY50 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC11CQ9BY50 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC11CQ9BY50 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC11CQ9BY50 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC11CQ9BY50 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEC11CQ9BY50 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEC11CQ9BY50 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEC11CQ9BY50 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEC11CQ9BY50 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEC11CQ9BY50 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC11CQ9BY50 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms