Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXU9

CALN1, Calcium-binding protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALN1Q9BXU9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CALN1Q9BXU9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALN1Q9BXU9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms