Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP2

SLC12A9, Solute carrier family 12 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A9Q9BXP2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC12A9Q9BXP2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC12A9Q9BXP2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC12A9Q9BXP2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC12A9Q9BXP2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A9Q9BXP2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A9Q9BXP2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A9Q9BXP2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A9Q9BXP2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A9Q9BXP2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A9Q9BXP2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A9Q9BXP2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A9Q9BXP2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A9Q9BXP2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A9Q9BXP2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A9Q9BXP2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC12A9Q9BXP2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC12A9Q9BXP2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC12A9Q9BXP2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC12A9Q9BXP2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC12A9Q9BXP2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC12A9Q9BXP2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC12A9Q9BXP2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A9Q9BXP2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms