Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LSM14BQ9BX40 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSM14BQ9BX40 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms