Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWU1

CDK19, Cyclin-dependent kinase 19, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK19Q9BWU1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CDK19Q9BWU1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CDK19Q9BWU1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CDK19Q9BWU1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CDK19Q9BWU1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CDK19Q9BWU1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CDK19Q9BWU1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CDK19Q9BWU1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CDK19Q9BWU1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CDK19Q9BWU1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CDK19Q9BWU1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CDK19Q9BWU1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CDK19Q9BWU1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CDK19Q9BWU1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CDK19Q9BWU1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CDK19Q9BWU1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDK19Q9BWU1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms