Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIOK2Q9BVS4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIOK2Q9BVS4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms