Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG8

KIFC3, Kinesin-like protein KIFC3, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3Q9BVG8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIFC3Q9BVG8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KIFC3Q9BVG8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIFC3Q9BVG8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIFC3Q9BVG8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIFC3Q9BVG8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIFC3Q9BVG8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIFC3Q9BVG8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIFC3Q9BVG8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KIFC3Q9BVG8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms