Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKNK1Q9BUB5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms