Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTN0

LRFN3, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN3Q9BTN0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRFN3Q9BTN0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRFN3Q9BTN0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRFN3Q9BTN0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRFN3Q9BTN0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRFN3Q9BTN0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRFN3Q9BTN0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRFN3Q9BTN0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRFN3Q9BTN0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRFN3Q9BTN0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRFN3Q9BTN0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRFN3Q9BTN0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRFN3Q9BTN0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRFN3Q9BTN0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRFN3Q9BTN0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRFN3Q9BTN0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRFN3Q9BTN0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRFN3Q9BTN0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRFN3Q9BTN0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRFN3Q9BTN0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRFN3Q9BTN0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRFN3Q9BTN0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRFN3Q9BTN0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRFN3Q9BTN0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRFN3Q9BTN0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRFN3Q9BTN0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRFN3Q9BTN0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRFN3Q9BTN0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms