Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCMBPQ9BTE3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms