Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPS4Q9BT78 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms