Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GINS3Q9BRX5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms