Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF559Q9BR84 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF559Q9BR84 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms