Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTP3Q9BQQ7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms