Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX50Q9BQ39 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms