Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPAS1Q99742 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPAS1Q99742 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms