Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTRQ99707 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTRQ99707 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTRQ99707 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MTRQ99707 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTRQ99707 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTRQ99707 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTRQ99707 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTRQ99707 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTRQ99707 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTRQ99707 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTRQ99707 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTRQ99707 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTRQ99707 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTRQ99707 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTRQ99707 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTRQ99707 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTRQ99707 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTRQ99707 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTRQ99707 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTRQ99707 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTRQ99707 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTRQ99707 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTRQ99707 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTRQ99707 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTRQ99707 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTRQ99707 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTRQ99707 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MTRQ99707 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTRQ99707 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTRQ99707 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTRQ99707 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTRQ99707 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MTRQ99707 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTRQ99707 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTRQ99707 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTRQ99707 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTRQ99707 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTRQ99707 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTRQ99707 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTRQ99707 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTRQ99707 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTRQ99707 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTRQ99707 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTRQ99707 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTRQ99707 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTRQ99707 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MTRQ99707 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTRQ99707 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTRQ99707 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTRQ99707 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTRQ99707 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTRQ99707 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTRQ99707 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTRQ99707 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTRQ99707 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTRQ99707 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTRQ99707 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTRQ99707 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTRQ99707 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTRQ99707 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTRQ99707 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTRQ99707 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MTRQ99707 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTRQ99707 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTRQ99707 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTRQ99707 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTRQ99707 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTRQ99707 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTRQ99707 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTRQ99707 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTRQ99707 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTRQ99707 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTRQ99707 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTRQ99707 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTRQ99707 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTRQ99707 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTRQ99707 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTRQ99707 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTRQ99707 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTRQ99707 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MTRQ99707 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTRQ99707 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTRQ99707 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTRQ99707 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTRQ99707 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTRQ99707 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTRQ99707 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTRQ99707 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTRQ99707 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTRQ99707 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTRQ99707 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTRQ99707 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTRQ99707 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MTRQ99707 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MTRQ99707 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTRQ99707 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTRQ99707 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTRQ99707 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MTRQ99707 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms