Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDCA3Q99618 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA3Q99618 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA3Q99618 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA3Q99618 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA3Q99618 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA3Q99618 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA3Q99618 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA3Q99618 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA3Q99618 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA3Q99618 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA3Q99618 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA3Q99618 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA3Q99618 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA3Q99618 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA3Q99618 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA3Q99618 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA3Q99618 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA3Q99618 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA3Q99618 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA3Q99618 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA3Q99618 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA3Q99618 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA3Q99618 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA3Q99618 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA3Q99618 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA3Q99618 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA3Q99618 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA3Q99618 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA3Q99618 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA3Q99618 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA3Q99618 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA3Q99618 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDCA3Q99618 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms