Protein–RNA interactions for Protein: Q99614

TTC1, Tetratricopeptide repeat protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC1Q99614 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC1Q99614 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms