Protein–RNA interactions for Protein: Q99467

CD180, CD180 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD180Q99467 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD180Q99467 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD180Q99467 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD180Q99467 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD180Q99467 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD180Q99467 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD180Q99467 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD180Q99467 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD180Q99467 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD180Q99467 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD180Q99467 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD180Q99467 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD180Q99467 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD180Q99467 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD180Q99467 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD180Q99467 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD180Q99467 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD180Q99467 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD180Q99467 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD180Q99467 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD180Q99467 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CD180Q99467 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CD180Q99467 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CD180Q99467 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD180Q99467 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD180Q99467 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD180Q99467 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD180Q99467 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD180Q99467 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD180Q99467 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD180Q99467 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD180Q99467 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD180Q99467 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD180Q99467 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD180Q99467 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD180Q99467 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD180Q99467 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD180Q99467 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD180Q99467 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD180Q99467 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD180Q99467 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD180Q99467 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD180Q99467 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD180Q99467 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD180Q99467 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD180Q99467 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD180Q99467 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD180Q99467 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD180Q99467 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD180Q99467 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD180Q99467 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD180Q99467 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD180Q99467 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD180Q99467 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD180Q99467 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD180Q99467 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD180Q99467 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD180Q99467 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD180Q99467 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD180Q99467 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD180Q99467 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD180Q99467 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD180Q99467 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CD180Q99467 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD180Q99467 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD180Q99467 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD180Q99467 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD180Q99467 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD180Q99467 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD180Q99467 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD180Q99467 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CD180Q99467 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD180Q99467 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD180Q99467 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD180Q99467 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD180Q99467 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD180Q99467 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD180Q99467 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD180Q99467 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD180Q99467 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD180Q99467 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD180Q99467 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD180Q99467 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD180Q99467 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD180Q99467 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD180Q99467 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CD180Q99467 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD180Q99467 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD180Q99467 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD180Q99467 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD180Q99467 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD180Q99467 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD180Q99467 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CD180Q99467 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD180Q99467 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD180Q99467 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD180Q99467 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD180Q99467 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD180Q99467 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD180Q99467 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms