Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMD1Q99460 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PSMD1Q99460 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMD1Q99460 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms