Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MMS19Q96T76 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMS19Q96T76 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms