Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBGCP5Q96RT8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms