Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX18Q96RF0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms