Protein–RNA interactions for Protein: Q96QA5

GSDMA, Gasdermin-A, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMAQ96QA5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GSDMAQ96QA5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSDMAQ96QA5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSDMAQ96QA5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GSDMAQ96QA5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSDMAQ96QA5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSDMAQ96QA5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSDMAQ96QA5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSDMAQ96QA5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSDMAQ96QA5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GSDMAQ96QA5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSDMAQ96QA5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSDMAQ96QA5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSDMAQ96QA5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSDMAQ96QA5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSDMAQ96QA5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSDMAQ96QA5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSDMAQ96QA5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSDMAQ96QA5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSDMAQ96QA5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GSDMAQ96QA5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSDMAQ96QA5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSDMAQ96QA5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSDMAQ96QA5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSDMAQ96QA5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSDMAQ96QA5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSDMAQ96QA5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSDMAQ96QA5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSDMAQ96QA5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSDMAQ96QA5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSDMAQ96QA5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSDMAQ96QA5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSDMAQ96QA5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSDMAQ96QA5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GSDMAQ96QA5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms