Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX3

ZNF48, Zinc finger protein 48, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF48Q96MX3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF48Q96MX3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF48Q96MX3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms