Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCMTD1Q96MG8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms