Protein–RNA interactions for Protein: Q96M19

LINC00477, Putative transmembrane protein encoded by LINC00477, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00477Q96M19 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00477Q96M19 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00477Q96M19 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms