Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC34.93■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC34.9■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
LRRIQ1Q96JM4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC34.81■■■■□ 3.16
LRRIQ1Q96JM4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
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