Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms