Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms