Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIC2Q96JB3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIC2Q96JB3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms