Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRIG1Q96JA1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms