Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARF2Q96GP6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SCARF2Q96GP6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARF2Q96GP6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms