Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC51Q96ER9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC51Q96ER9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms