Protein–RNA interactions for Protein: Q96E22

NUS1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit NUS1, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUS1Q96E22 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUS1Q96E22 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUS1Q96E22 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms