Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRRFQ96E11 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRRFQ96E11 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
MRRFQ96E11 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRRFQ96E11 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRRFQ96E11 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRRFQ96E11 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRRFQ96E11 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRRFQ96E11 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRRFQ96E11 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MRRFQ96E11 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRRFQ96E11 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRRFQ96E11 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRRFQ96E11 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms