Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
OPTNQ96CV9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
OPTNQ96CV9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms