Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDF1Q96CC6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDF1Q96CC6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDF1Q96CC6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDF1Q96CC6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDF1Q96CC6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDF1Q96CC6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDF1Q96CC6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDF1Q96CC6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDF1Q96CC6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDF1Q96CC6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDF1Q96CC6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDF1Q96CC6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDF1Q96CC6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDF1Q96CC6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDF1Q96CC6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDF1Q96CC6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDF1Q96CC6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDF1Q96CC6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDF1Q96CC6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDF1Q96CC6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RHBDF1Q96CC6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RHBDF1Q96CC6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RHBDF1Q96CC6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RHBDF1Q96CC6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RHBDF1Q96CC6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHBDF1Q96CC6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms