Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC8Q96B26 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC8Q96B26 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC8Q96B26 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC8Q96B26 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC8Q96B26 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC8Q96B26 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC8Q96B26 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC8Q96B26 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC8Q96B26 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC8Q96B26 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC8Q96B26 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC8Q96B26 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC8Q96B26 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC8Q96B26 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC8Q96B26 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC8Q96B26 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC8Q96B26 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC8Q96B26 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC8Q96B26 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC8Q96B26 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC8Q96B26 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC8Q96B26 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC8Q96B26 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
EXOSC8Q96B26 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC8Q96B26 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms