Protein–RNA interactions for Protein: Q96A29

SLC35C1, GDP-fucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C1Q96A29 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC35C1Q96A29 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC35C1Q96A29 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC35C1Q96A29 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC35C1Q96A29 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC35C1Q96A29 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC35C1Q96A29 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC35C1Q96A29 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC35C1Q96A29 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC35C1Q96A29 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC35C1Q96A29 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC35C1Q96A29 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC35C1Q96A29 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC35C1Q96A29 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC35C1Q96A29 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms