Protein–RNA interactions for Protein: Q969H4

CNKSR1, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR1Q969H4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNKSR1Q969H4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNKSR1Q969H4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNKSR1Q969H4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNKSR1Q969H4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNKSR1Q969H4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNKSR1Q969H4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNKSR1Q969H4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNKSR1Q969H4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNKSR1Q969H4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNKSR1Q969H4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNKSR1Q969H4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNKSR1Q969H4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNKSR1Q969H4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNKSR1Q969H4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNKSR1Q969H4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNKSR1Q969H4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNKSR1Q969H4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNKSR1Q969H4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNKSR1Q969H4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNKSR1Q969H4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNKSR1Q969H4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNKSR1Q969H4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNKSR1Q969H4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNKSR1Q969H4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CNKSR1Q969H4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNKSR1Q969H4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNKSR1Q969H4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CNKSR1Q969H4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNKSR1Q969H4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNKSR1Q969H4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNKSR1Q969H4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CNKSR1Q969H4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNKSR1Q969H4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms