Protein–RNA interactions for Protein: Q969G2

LHX4, LIM/homeobox protein Lhx4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4Q969G2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX4Q969G2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms