Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-CQ95604 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms